風冷式冷水機與水冷式冷水機，各有其自身的特點，要根據不同的使用環境、空間、及所需機組的制冷量大小、和不同的城市 地域等來進行綜合考慮加以選擇。

風冷式冷水機組采用空氣冷卻方式，省去了冷卻水系統所必不可少的冷卻塔、冷卻水泵和管道系統，避免水質過差地區造成冷凝器結垢、水管堵塞，還節約了水資源，是目前冷水空調設備產品中，保養維修最經濟、簡單的機種。

風冷式冷水機組比水冷式冷水機組一次性投資要稍高，但是全年運轉費用要低于水冷式冷水機組，機房建筑費用在各種空調冷熱源系統中為最少，維修保養費用約為水冷式或鍋爐的一半費用。 風冷機組的噪音和體積較水冷的大，只能按裝在室外。水冷機組大多按裝在地下室內。

水冷式冷水機則是通過冷水機的制冷系統冷卻循環水，再通過水泵以及冷卻水路輸送給設備。水冷式冷水機受環境的影響相對較小，但是需要企業有良好優質的水源供循環冷卻，由于配有水塔的原因，水冷式冷水機占用面積較大，安裝維護工作量較大。