2005年轄：2個地級市、7個地區、5個自治州；11個市轄區、20個縣級市、62個縣、6個自治縣。　
鄯善縣　哈密市　伊吾縣　和田市　和田縣　洛浦縣　民豐縣　皮山縣　策勒縣
于田縣　墨玉縣　溫宿縣　沙雅縣　拜城縣　庫車縣　柯坪縣　新和縣　烏什縣
喀什市　巴楚縣　澤普縣　伽師縣　葉城縣　疏勒縣　莎車縣　疏附縣　烏恰縣
和靜縣　尉犁縣　和碩縣　且末縣　博湖縣　輪臺縣　若羌縣　昌吉市　阜康市
米泉市　奇臺縣　博樂市　精河縣　溫泉縣　伊寧市　奎屯市　伊寧縣　昭蘇縣
新源縣　霍城縣　鞏留縣　塔城市　烏蘇市　額敏縣　裕民縣　沙灣縣　托里縣
青河縣　富蘊縣　福海縣　
石河子市　阿拉爾市　五家渠市　吐魯番市　托克遜縣　阿克蘇市　阿瓦提縣
岳普湖縣　麥蓋提縣　英吉沙縣　阿圖什市　阿合奇縣　阿克陶縣　庫爾勒市
瑪納斯縣　呼圖壁縣　特克斯縣　尼勒克縣　吉木乃縣　布爾津縣　哈巴河縣　
阿勒泰市　烏魯木齊市　烏魯木齊縣　克拉瑪依市　圖木舒克市　吉木薩爾縣　
巴里坤哈薩克自治縣　塔什庫爾干塔吉克自治縣　焉耆回族自治縣　
察布查爾錫伯自治縣　木壘哈薩克自治縣　和布克賽爾蒙古自治縣　
伊吾