線切割機床兩軸的垂直度是建立在各自的直線度的基礎上的，直線的誤差會在垂直度測量時反映出來，數值疊加的結果使垂直度測量失實失準，所以是首先保證各自的直線度，再保證互相的垂直度。 
　線切割機床兩軸的垂直度完全取決于中托板上的兩組導軌的垂直度，裝配時是把一組導軌固定在基準上，測量并調整待另一組導軌與基準垂直后，再行固定并配打銷釘孔，從而把中托板上兩組導軌的垂直度固定下來。這個裝配和測量過程，即要追求操作的穩妥有效，還應該有意把精度提高一檔，這個中間工藝指標的控制是非常重要的，因為不管是裝機，修理或一段時間的實效，都會使這個精度變差，如果初始安裝就把允許的誤差值用足，那以后的精度就會超值失準了。比如某機床精度標準為0.02，則首次裝配時的內控精度應是在0.012以下。重要部位的首裝嚴控和銷釘鏍釘穩妥有效，加之導軌本身的平直精準，兩軸的垂直度就有保證了。 
　如同直線度一樣，絲杠的工作狀態也是影響垂直度的重要因素。與導軌定位面成一定夾角的任何一個外力，都將造成導軌的異動，因為導軌只是導軌，并沒有夾死。所以一旦發現X、Y軸的垂直度超標，要認真判斷是導軌自身的形變或錯位造成的還是絲杠的運動干擾的。如果是導軌的導向作用所致，分別在幾個位置使絲杠和絲母重復松開再緊固的適配過程，其超標的方向和數值應大體穩定的。如果是絲杠和絲母運動的干擾所致，將失去方向和數值的規律性。千萬不可盲目把導軌的固定松開，把銷釘撥掉，失去判斷的任何操作都是無益的。一旦導軌的固定松開銷釘撥掉，就必須重復前面所述首次
調的全過程。 
　任何測量調整都必須在導軌運動平穩之后再進行，如果突跳和無規律的扭擺，那是導軌太臟或異物，要堅決拭凈潤滑之后再進行調整，這是必須牢記的。