一般的骨科和急診醫師對齒狀突加冠綜合征的認識不夠，常規頸椎X線平片往往發現不了問題，且齒狀突加冠綜合征患者常有發熱和升高的炎性指標。因此，在臨床上，齒狀突加冠綜合征常被誤診為感染、頸椎病、強直性脊柱炎、類風濕關節炎、痛風、腦膜炎、轉移性脊柱腫瘤等，導致不必要的手術和藥物治療（如抗生素）、頻繁的就醫及延長的住院時間。另外，齒狀突加冠綜合征還應與兒童鈣化性椎間盤炎（兒童椎間盤鈣化癥）相鑒別，后者為自限性疾病，多發于6～10歲，多以頸痛為主訴，實驗室檢查少數會出現白細胞增高，血沉加快，影像學多表現為單間隙椎間盤鈣化。

治療與預后齒狀突加冠綜合征通常預后良好，癥狀一般在幾周內消退。非甾體藥或短程中等劑量的皮質類固醇可快速、完全地緩解患者癥狀。目前認為，兩者合用是治療方案，但通常不需要長期使用。如果正確診斷了齒狀突加冠綜合征可以免去不必要的診治。