直接接觸性用水

盡管市政供水通常不含有害或致病微生物，但也不完全如此。此外，來自個別水源，如天然泉水或井水也可能受到污染。任何用于食品或飲料產品的配料水，或與產品直接接觸的水，都可能成為污染源。紫外線能夠在不使用化學物質、不進行加熱的情況下對產品進行消毒。同時，紫外線消毒法能使生產用水得到再次利用，既節約成本又在保障產品質量的基礎上提高了產量。

CIP(就地清洗)漂清用水

微生物安全性對用作最后CIP漂洗用水及消毒方案都是至關重要的。全自動紫外線消毒系統能夠結合CIP漂清周期使用，確保最終的漂清用水不會再次引入微生物污染。由于中壓紫外燈管自身的機械強度高，它們不會受到CIP水溫突變的影響。

過濾消毒

反滲透(RO)和顆粒狀活性碳(GAC)過濾法常被用來過濾生產用水，但是也可能成為細菌的滋生地。紫外線能夠有效地消毒RO和GAC的產水，而且已在加工產業中使用多年。

脫氯

GAC過濾器常被用來脫去生產用水中的，除去由于氯水消毒“揮發出”的氣味，從而保證最終產品的味道不走樣、沒有任何多余的味道或氣味。將紫外線消毒系統安裝在GAC過濾器前，能夠改善GAC過濾器的性能，延長活性碳的使用壽命，從而降低運營成本。

糖漿

糖漿可能是微生物最理想的滋生場所。盡管糖份含量很高的糖漿并不利于微生物的生長，但是休眠的孢子會在糖漿被稀釋后恢復活性。在加工糖漿和稀釋時進行紫外線消毒能夠確保休眠的孢子完全失去活性。