水箱清潔和消毒成為衛生監測部門的重要檢查環節。水箱自潔消毒器現已通過國家衛生部門組織的鑒定，按企業標準生產。通過循環微電解水中物質（二氧化氯（CIO2），臭氧（O3），活性氧（O）、分子氯（Cl2）等）產生氧化物質殺滅飲水中的細菌；

外置式水箱自潔消毒器安裝于水箱外面，水箱需在上下兩側單獨開出兩個管道與水箱消毒器的進出水口相連，下進上出循環流動。水箱自潔消毒器后攜帶臭氧返回到水箱內，與水箱水混合消毒。